<div dir="ltr"><div>Hi there,</div><div><br></div><div>I was curious if the previous Stemformatics grant means that I'm disqualified from suggesting another grant.</div><div><br></div><div>If not, I thought about an idea around the UX related grants mentioned in conjunction with Cartesian Creative. </div><div><br></div><div>The idea is around providing a stand alone application of a metadata annotation validation and excel spreadsheet like functionality. It would allow users to annotate large volumes of metadata while still providing an ontology/validation system. Eg. 1500 samples need to be annotated in Stemformatics. These samples need to be annotated against a controlled vocabulary called an ontology.</div><div><br></div><div>The idea is that a standalone application could be connected into other web based systems. I have received some feedback from other providers that this might be useful.<br></div><div><br></div><div>I first suggested this for the 2016 Health Hack (attached) but I didn't communicate my ideas very well. Since then I have provided a mockup to <a href="https://app.moqups.com/rowlandm/1xlCPCReH9/view/page/a6c9e06c4">help communicate this idea</a></div><div><br></div><div>The concern I have now is that the solution/idea that I described previously isn't scalable for the new world of single cell RNASeq (over 10,000 rows in a web based application is a lot). I think I would need to get a UX expert to work with our team and the other interested providers to define the outline of a solution. I'm unsure of the costs of this and even if this would be considered worthwhile.</div><div><br></div><div>Would it be worthwhile to discuss this further with someone?<br></div><div><br></div><div>I have cc'ed the linux-aus mailing list because I am worried that something might also exist that I don't know about. When I did look last year, t<span style="font-size:12.8px">here didn't seem to be many out there. Most of them were specific solutions:</span></div><div><div style="font-size:12.8px"><ol><li style="margin-left:15px">Sufia (based on Hydra and PDCM) is for uploading files</li><li style="margin-left:15px">Picture Park is commercial and doesn't have an excel like interface</li><li style="margin-left:15px">AirBNB has a workflow process but not really a stand alone data annotation tool</li><li style="margin-left:15px">It's actually hard to find a batch annotation tool</li></ol></div></div><div><br></div><div>Any information would be greatly appreciated!</div><div><br></div><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div style="font-size:small"><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px">Regards,</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Rowland</div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">------------</div><div style="font-size:small">                    <br><font color="#0b5394">Rowland Mosbergen | Business Manager, Stemformatics<br>Wells Laboratory | Centre for Stem Cell Systems<br>Department of Anatomy and Neuroscience | Faculty of Medicine, Dentistry and Health Sciences<br><br>Room 1.36, Level 1, Kenneth Myer Building<br>The University of Melbourne, Victoria 3010 Australia<br>T: +61 3 8344 6623 | E: <a href="mailto:rowland@stemformatics.org" target="_blank">rowland@stemformatics.org</a><br>W: <a href="http://www.stemformatics.org" target="_blank">www.stemformatics.org</a>  | Skype: rowland.stemformatics</font><div style="font-size:12.8px"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div style="font-size:small"><br><p style="font-size:12.8px"><span style="font-size:10pt;color:rgb(31,73,125)"><img border="0" width="187" height="62" src="cid:image001.jpg@01D23054.2AFC2740" alt="id:image001.jpg@01D20A8D.3D4A4630"></span><u></u><u></u></p><p style="font-size:12.8px"><span style="font-size:10.5pt;color:rgb(145,145,145)"> </span><u></u><u></u></p><p style="font-size:12.8px"><span style="font-size:7.5pt;font-family:Arial,sans-serif;color:rgb(145,145,145)">This email and any attachments may contain personal information or  information that is otherwise confidential or the subject of copyright. Any use, disclosure or copying of any part of it is prohibited. The University does not warrant that this email or any attachments are free from viruses or defects. Please check any attachments for viruses and defects before opening them. If this email is received in error please delete it and notify us by return email.</span></p></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><div style="font-size:12.8px"><div style="font-size:12.8px"><div><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div style="font-size:small"><p style="font-size:12.8px"><span style="font-size:10.5pt;color:rgb(145,145,145)"> </span><u></u><u></u></p><p style="font-size:12.8px"><span style="font-size:7.5pt;font-family:Arial,sans-serif;color:rgb(145,145,145)">This email and any attachments may contain personal information or  information that is otherwise confidential or the subject of copyright. Any use, disclosure or copying of any part of it is prohibited. The University does not warrant that this email or any attachments are free from viruses or defects. Please check any attachments for viruses and defects before opening them. If this email is received in error please delete it and notify us by return email.</span></p></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>